Ученый совет Института осуществляет общую координацию работы в части учебной, учебно-методической, научно-исследовательской, научно-методической работы, комплектования и подготовки научно-педагогических кадров.
Состав Ученого Совета утверждается ректором института, сроком на 2 года по согласованию с Общим собранием учредителей и уполномоченным государственным органом в области образования и науки КР. Председателем Ученого Совета является Ректор Института.
В состав Ученого Совета входят ректор, проректора, начальник учебно-методического отдела, заведующие кафедрами, руководители других научно-педагогических подразделений, студенческих общественных организаций. Также, в состав ученого совета входят представители факультетов и других структурных учебных подразделений, из числа ведущих ученых, профессоров и доцентов, избранных в установленном порядке.